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CNSでは，ユーザの利用するファイルは基本的にホームディレクトリ以下のディレクトリに保存しますが，授業などで多くのユーザが同じファイルを利用する場合や，容量の大きなファイルを多数保存するときのために共有ディレクトリ (/pub/) が用意されています．このディレクトリには特に公共性の高いファイルが集められています．必要に応じて参照してください．
SFC固有のファイルがおかれています． 次 にあげるようなディレクトリの他， 個別のプロジェクトや団体で共有しているファイルが おかれています．
| ディレクトリ | 内容 |
| bin | 共通に使われるコマンドスクリプト |
| ipl | 情報処理の授業で使われるソフトウェアや資料 |
さまざまな文学作品がおかれています． 次 にあげるようなディレクトリがあります．
| ディレクトリ | 内容 |
| gutenberg | Gutenbergプロジェクトの利用法について述べられたドキュメント |
| shakespeare | シェイクスピアの作品 |
/pub/src/以下のディレクトリには， UNIX で使用するアプリケーションのコンパイル前のソースファイルが置いてあります． そのうちの多くがフリーソフトウェアです． このディレクトリに置いてあるようなソースファイルはできるだけ個人で持たないようにしてください． 1度置かれたものは， 特別の事情がない限り 古いバージョンも含めて消されることはありません．
また， srcディレクトリにアーカイブしてほしいフリーソフトウェアなどの要望は， cns-request@sfc.keio.ac.jp で受け付けています．